Comment la protéine se plie-t-elle?

Comment la protéine se plie-t-elle? *note: cet article est tiré du livre la boîte noire darwin: le défi biochimique de l'évolution. La protéine contient habituellement entre 50 et 3000 acides aminés ivres, et la séquence initiale d'acides aminés dans la protéine est appelée la structure primaire, et la protéine complétée aura toujours des extrémités libres du groupe aminé généralement dénoté par l'extrémité terminale (N) et un groupe carboxylique gratuit appelé fin terminale (C). La séquence aminé est généralement écrite à partir du terminal (N) au terminal (C). Dans un processus intéressant, presque toutes les protéines sont impliquées dans la formation de structures précises et distinctes qui peuvent être complètement différentes entre les différentes protéines, et cela se produit automatiquement à la suite de différentes interactions, comme attirer des chaînes positivement chargées et négativement chargées, ou combiner des chaînes latérales hydrophobes pour les séparer, ou excluant les grandes chaînes latérales des espaces étroits et ainsi de suite. Quand les protéines sont impliquées, elles ne s'empilent pas soudainement, comme une protéine le fait dans votre main quand il s'empile, mais il ya des règles qui régulent cette action. Avant qu'une protéine soit impliquée, les atomes de son ossature polaire - l'oxygène, l'azote et les atomes d'hydrogène dans chaque liaison de peptide - formeront ce qu'on appelle un lien d'hydrogène avec des molécules d'eau. D'abord, les parties de la protéine peuvent former une structure appelée alpha helix, auquel cas la colonne vertébrale de la protéine s'enveloppera, et cette géométrie de contournement fait les atomes d'oxygène dans les groupes de peptide correspond directement aux atomes d'hydrogène des groupes de peptide dans les quatre brins d'amino le long de la chaîne formant des liaisons d'hydrogène. Dans cette structure, la colonne vertébrale de la protéine est comme la plaque de pliage, en haut et en bas, et les atomes de peptide se fixent à la surface de la pente selon la direction de la chaîne, puis la chaîne roule en arrière. Les escargots et les plaques sont définis comme la structure secondaire des protéines. Une protéine typique a 40 à 50 pour cent des résidus aminés contenus dans ces escargots ou plaques. Les acides restants entreront entre les sections de la structure secondaire ou formeront des structures irrégulières. Les hélices et les plaques sont empilées l'un contre l'autre pour former, dans la plupart des cas, une protéine sphérique, la façon dont les éléments de la structure secondaire sont empilés est appelée la structure tertiaire de la protéine, et la force motrice de l'hélix et l'empilage de la plaque provient de la nature huileuse de nombreux acides aminés. Comme les huiles séparées de l'eau par une couche distincte, les chaînes hydrophobes se combinent pour former une zone exempte d'eau dans la protéine. Cependant, rappelez-vous que certaines chaînes latérales de protéines sont polarisées ou chargées et préfèrent rester dans l'eau, d'où l'information qui conduit une protéine particulière à se plier dans une structure spécifique, comme le modèle de chaînes latérales polarisées ou huileuses dans la séquence d'acide aminé. Un autre facteur qui contribue également au pliage des protéines est que dans toutes les protéines intégrées, certaines des chaînes polaires sont intégrées dans une structure hydrophobique. Si les atomes polaires ne peuvent pas trouver un partenaire avec lequel former des liaisons d'hydrogène, alors l'équilibre des protéines est perturbé, mais dans la plupart des protéines, environ 90% des chaînes polaires intégrées forment des liaisons d'hydrogène avec les atomes de la structure des protéines ou avec d'autres chaînes latérales. De nombreux peptides se rejoignent en haute qualité pour former une structure qui agit comme une unité complète, et dans de tels cas, il est habituel de se référer aux chaînes de peptide associées comme une seule protéine composée de nombreuses sous-unités. Par exemple, l'hémoglobine (une protéine de carrying d'oxygène) est composée de quatre peptides, et la protéine assemblée de ces chaînes est capable de fonctionner comme un transporteur d'oxygène. - Dr Michael Behe. — Source : site Web du centre brahin - publié le 2018-10-11 (archivé dans l'archive internet) https://braheen.com/articles/evolution-design/كيف-يحدث-طي-البروتينات