L'ingénierie des enzymes riboses n'imite pas l'évolution chimique non guidée.

L'ingénierie des enzymes riboses n'imite pas l'évolution chimique non guidée. *Note : Cet article est tiré du livre (Signature in the Cell: DNA and Intelligent Design Guides) pour plus de renseignements, veuillez consulter le livre. En raison des difficultés de l'hypothèse mondiale de l'ARN et du nombre limité de fonctions enzymatiques qui peuvent être accomplies par des enzymes ribosomiques naturellement présentes, une nouvelle industrie de laboratoire s'est répandue dans la biologie moléculaire, car les scientifiques défendant l'idée du monde de l'ARN ont cherché à concevoir de nouvelles molécules d'ARN avec des fonctions que nous n'avions pas vues auparavant, espérant ainsi augmenter leurs connaissances sur la chimie artificielle, mais aussi démontrer le monde Typiquement, ces expériences d'ingénierie des enzymes de dépôt utilisent l'une des deux méthodes: la méthode de «sense design» ou la méthode «évolution dirigée»; dans les deux cas, les biologistes cherchent à produire des copies plus efficaces de nouvelles enzymes de dépôt ou des enzymes ribosomiques qui sont capables d'accomplir certaines autres fonctions protéiques. Dans l'évolution dirigée (ou "conception acoustique"), les scientifiques essaient de simuler une forme de sélection naturelle prébiotique pour produire des enzymes ribosomiques avec des capacités fonctionnelles améliorées, en passant par des groupes de molécules d'ARN utilisant des pièges chimiques pour isoler des molécules qui accomplissent certaines fonctions, et après avoir sélectionné ces molécules du groupe, générant diverses copies de ces molécules. Par modification aléatoire (mutation) d'une partie de la séquence de la molécule originale, ils sélectionnent ensuite les molécules les plus fonctionnelles de ce nouveau groupe et répètent le processus plusieurs fois jusqu'à ce qu'il produise une augmentation mesurable de la fonction souhaitée. La plupart de l'ingénierie des enzymes ribosomiques a été faite sur des ligases, qui sont des ribosomes qui peuvent lier deux séquences RNA (oligomères) ensemble en formant un seul lien ( phosphorylation de biester) entre eux, et les ingénieurs de ligase veulent prouver que ces ligases peuvent également être converties en véritables polymérases ou "ribloïdes", mais ces polymères ne se lient pas seulement. Selon l'hypothèse du monde de l'ARN, une fois qu'un polymérase autoréplicateur est créé par un modèle, il fera de la sélection naturelle un facteur de l'évolution chimique post-vie, et puisque la ligase accomplit une et seulement une des nombreuses fonctions que la polymérase réelle accomplit, les théoriciens du monde de l'AR ont spéculé que la molécule d'origine est la molécule. Personne n'a encore réussi à fabriquer des polymérases à base d'ARN basés sur des ARN entièrement fonctionnels, tant de Ligaz qu'ailleurs.41 Mais les ingénieurs des enzymes ribosomes ont utilisé l'évolution dirigée pour améliorer la fonction de certains types communs de ligazes, et comme nous l'avons déjà noté, ils ont également produit une molécule qui peut reproduire une petite fraction de lui-même. Cependant, ces affirmations ont un désavantage évident : les ingénieurs des enzymes ribosomiques ont tendance à négliger le rôle de leur intelligence dans l'amélioration des capacités fonctionnelles des catalyseurs de l'ARN qu'ils ont produit, car la façon dont les ingénieurs ont utilisé leur intelligence pour aider l'évolution dirigée n'a pas d'équivalent dans les conditions du monde prébiotique – du moins dans un monde où seuls les processus non-directionnels ont entraîné l'évolution chimique supposée – bien que sont les mêmes conditions que l'enzymes. Les promoteurs du monde de la transcription imaginent l'évolution des ligases à travers un processus non dirigé, en commençant par des bases libres, ou en utilisant des polymérases ligase-enhanced qui peuvent se multiplier, puis en créant les conditions pour le début de la sélection naturelle, en d'autres termes; ces expériences essaient de simuler une transition qui se produit, selon la théorie du monde de l'AR, avant même la sélection naturelle. Shostak et ses collègues ne nous ont pas dit, certainement ils ne peuvent pas dire que la sélection naturelle a joué ce rôle, parce que le processus de sélection naturelle dépend de la création préalable de la molécule autoréplicatrice que Shostak et ses collègues travaillent à concevoir, mais plutôt Shostak et ses collègues ont pratiqué un rôle que la nature ne peut pas avant la création d'un système autoréplicateur, ou au moins une molécule autoréplicatrice. Shostak et ses collègues ont travaillé des multiples, générant une grande quantité de séquences différentes, en choisissant des séquences qui resteraient à subir une autre série d'évolution dirigée, et même en les choisissant basés sur une vision future que ni la sélection naturelle ni aucun processus non intelligent ou non dirigé (par lui-même),43 les caractéristiques des molécules RNA que Shostak et ses collègues isolés et sélectionnés ne confèrent aucun avantage fonctionnel sur la molécule précellulaire du monde. Bien sûr, les enzymes ligase exécutent des fonctions dans les cellules contemporaines qui donnent un avantage sélectif aux cellules qu'elles contiennent, mais avant la création de la première protocelle autoréplique, les ribosomes ligase n'avaient aucun avantage fonctionnel sur d'autres molécules d'ARN, donc à ce stade de développement chimique il n'y avait pas de système autoréplicateur pour leur donner tout avantage. La capacité de lier les chaînes de nucléotides est essentielle (à son meilleur), mais il ne suffit pas d'exécuter la fonction de polymérase ou de ribale, et en l'absence d'une molécule (ou d'un système moléculaire, qui est plus probable) avec toutes les caractéristiques requises pour l'autoréplication, la nature ne préférera pas n'importe quelle molécule RNA à d'autres molécules; la sélection naturelle ne joue jamais un rôle autre que de l'évolution fonctionnellement utile Comme les expériences en ingénierie ribo-enzymes ont un rôle plus clair pour l'intelligence car elles utilisent le design sain (par opposition à l'évolution directe), elles reflètent toujours le même problème. 40. szostak, bartel et luisi, «la vie de synthétisation». 41. szostak, bartel et luisi, «la vie de synthétisation», 388; loup et koonin, «à l’origine du système de traduction». 42. Eckland et al. ont affirmé que les ribosomes efficaces sont plus fréquents dans les séquences de l'ARN qu'auparavant (le nombre total de combinaisons de nucléotides possibles) correspondant aux molécules d'ARN à 220 bases. Étant donné qu'ils ont pu isoler le ribosome des ligas en recherchant une petite fraction de l'ensemble de la zone (environ 1,4 x 1015 séquences séparées), cela signifiait que l'ensemble de la zone contiendrait un grand nombre de ligas comparables. Mais pour une telle fonction simple d'exiger une seule séquence dans un trillion, il soulève des questions sérieuses sur la rareté des fonctions plus complexes. Comme noté, par exemple, l'ingénierie des enzymes ribosomiques n'a pas encore produit un seul ribozyme capable d'exécuter une véritable activité polymérase. 43. Comme le note Wolf et Konin: «Parce que l'évolution n'a pas de prévoyance, aucun système ne peut évoluer avec l'attente qu'il deviendra utile une fois le niveau de complexité requis atteint.» Wolf, yuri i., et eugene v. koonin. “à l’origine du système de traduction et du code génétique dans le monde de l’ARN par le biais de la sélection naturelle, l’exaptation et la subfonctionnalisation.” biologie directe 2 (2007): 1–25. - Dr Steven Meyer. — Source : site Web du centre brahin - publié le 2018-10-12 (archivé dans l'archive internet) https://braheen.com/articles/evolution-design/هندسة-الإنزيمات-الريبوزية-لا-تحاكي-التطور-الكيميائي-غير-الموجه