En ne lisant pas le livre: une réponse à francisco ayala (2)

En ne lisant pas le livre: une réponse à francisco ayala (2) Par : dr. stephen mayer L’examen le plus proche de Ayala pour réaliser l’argument positif central du livre est sa tentative maladroite de réfuter l’idée d’un design intelligent en insistant sur le fait que l’existence de séquences «non-senses» ou de drogués dans le génome humain ne s’est pas avérée être issue d’un design intelligent. Encore une fois, je me demande si le professeur Ayala regarde les pages du livre. Mon livre n'est pas sur l'émergence du génome humain, ni sur l'évolution humaine, ni même sur l'évolution biologique en général. C'est sur l'évolution chimique, l'émergence de la première vie et l'information génétique nécessaire pour la produire. J'ai simplement admis dans la conclusion que quelqu'un peut, en principe, accepter mon argument sur le design intelligent de la vie précoce, ainsi que l'explication moderne habituelle de la façon dont les formes de vie ultérieures ont évolué. Je ne crois pas à la vision du design « front-end loading », mais mon livre ne tente pas de réfuter cette vision, ni les explications habituelles de l'évolution biologique. C'est pourquoi la tentative d'Ayala pour défendre l'évolution biologique et réfuter la théorie selon laquelle le design intelligent a joué un rôle distinctif dans la genèse du génome humain ne peut être considérée de quelque manière que ce soit comme une réponse à un argument de signature dans la cellule. Il est intéressant de noter, cependant, que l'argument d'Ayala contre la conception intelligente du génome humain, basé sur l'existence d'une signature d'ADN dite « jante » ou « sans signification », est basé sur deux hypothèses erronées, dépassées et invalides. Ayala souligne qu'aucun designer ne mérite la fonction adjective « intelligente » pour permettre au génome humain d'être rempli de séquences aléatoires. Le résultat est que l'Ayala affirme essentiellement que (1) la multiplicité des séquences d'ADN sans signification et (2) la distribution aléatoire de ces séquences montrent que le génome humain est impossible à concevoir. Mais ces deux faits allégués sur lesquels l'Ayala fonde son argument sont faux. D'abord, ni le génome humain ni le génome d'autres organismes ne sont dominés par l'ADN de la jonction. Comme je l'ai documenté dans un livre de signature dans la cellule, il est maintenant connu que les régions non codées de protéines dans les génomes (dans les organismes différents) qui ont longtemps été pensés être "junk" ou "sans signification" accomplissent de nombreuses fonctions importantes. Les séquences Alu que l'Ayala cite en particulier, comme exemples principaux de nombreuses séquences sans signification distribuées aléatoirement dans le génome humain, ne sont pas non fonctionnelles ou « sans signification ». Les séquences d'éléments nucléaires (SINE), dont Alu est membre, exercent plusieurs fonctions de coordination et de réglementation dans les génomes de tous les organismes en eux, et la revendication d'Ayala au contraire est incorrecte. Les séquences SINES (y compris Alu) permettent de récupérer l'information génétique de différentes façons à partir des mêmes fichiers de données d'ADN en fonction des besoins spécifiques des tissus ou des différents modèles cellulaires (et dans différents contextes spécifiques à l'organisme). En particulier, les séquences Alu effectuent de nombreuses fonctions de coordination génomique de niveau inférieur, telles que: 1 Introduction de sites de démarrage alternatifs pour les unités promotrices dans l'expression du gène, semblable à la fragmentation du disque dur de l'ordinateur (Faulkner et al., 2009; Faulkner et Carninci, 2009) (2) transcription de l'ARN de curb ou de « silence » (trujillo et al., 2006) (3) Division dynamique d'un fichier génique provenant d'autres fichiers sur le chromosome (Lunyak et al., 2007) (4) Introduction d'un contrat d'ADN pour les voies de transduction de signaux ou les sites de liaison pour les récepteurs hormonaux (Jacobsen et al., 2009; Laperriere et al., 2004) 5 molécules d'ARN codantes modulent la transcription (allen et al., 2004; espinoza et al., 2004; walters et al., 2009). 6 Codage ou régulation des molécules de mRNA (Gu et al., 2009; Lehnert et al., 2009). En plus de ces fonctions de coordination génomique au niveau inférieur, les SINEs (y compris ALu) exercent également des fonctions de coordination générique au niveau supérieur telles que: 1 Modification chromatique des gènes de transduction de signaux et des gènes d'entretien ménager riches en GC (Grover et al., 2003, 2004; Oei et al., 2004; Eller et al., 2007) (2) « codage à barres » pour les parties personnalisées de bouchons de chromatine entre amplificateurs et amplificateurs (Ford et Thanos, 2010) (3) Recombination dans les séquences où Alu est présent (Witherspoon et al., 2009) 4 Aider à la coordination des régions chromosomes 3D ou "chambers" dans le noyau (Kaplan et al., 1993; Pai et Engelke, 2010). Les séquences Alu attribuent également de nombreux codes d'ARN qualitatifs au type, où elles sont particulièrement rendues: 1 Signalisation de molécules d'ARN alternatives (c.-à-d. générant plusieurs molécules d'ARN différentes de la même version initiale) (Gal-Mark et al., 2008; Lei et Vorechovsky, 2005; Lev-Maor et al., 2008) 2 autres cadres de lecture ouvert (exons) (lev-maor et al., 2007; lin et al., 2008; schwartz et al., 2009) (3) Détermine la rétention de certaines molécules d'ARN dans le noyau pour supprimer leur expression (Chen et al., 2008; Walters et al., 2009) (4) L'ARN polymerase II est réglementée pendant la transcription (Mariner et al., 2008; Yakovchuk et al., 2009; Walters et al., 2009) 5 Les sites de modulation de l'ARN fournissent de l'adénine à l'inosine, qui est une fonction essentielle pour le développement du cerveau humain et spécifique à l'espèce (Walters et al., 2009). Contrairement à la revendication d'Ayala, les séquences Alu (et d'autres SINEs dans les mammifères) ne sont pas distribuées au hasard, mais présentent un modèle de distribution semblable de « codage et nom » le long de leurs chromosomes (Chen et Manu-Elidis, 1989; Gibbs et al., 2004; Korenberg et Rykowski, 1988) La distribution du « code barre » des séquences Alu - semblable à la distribution des italiques, des semi-colons et des espaces utilisés pour formater le code d'un programme informatique - reflète (avec d'autres SINEs) une logique fonctionnelle claire, pas de typage insouciant ou de mutagénèses aléatoires. Par exemple, les séquences Alu ont tendance à localiser dans et autour des gènes de codage protéique adaptés à leur rôle dans la régulation de l'expression génétique (Tsirigos et Rigoutsos, 2009). Il se trouve principalement dans les régions adsorbantes (site d'initiation de la production de l'ARN) et dans les introns (coups qui séparent les distances de codage des protéines).Le nombre de séquences Alu est sévèrement réduit à l'extérieur de ces régions. Nous savons aussi maintenant que les séquences Alu sont dirigées vers (ou enchevêtrées) certaines régions actives préférées dans le génome par des complexes protéiques ou la « machine intégrée » d'un système de traitement de l'information cellulaire (Levy et al. Cette distribution ciblée des séquences Alu améliore la régulation sémantique et syntactique de l'ADN humain, et ne semble pas être une preuve de mutations d'entrée aléatoires, contrairement à l'argument d'Ayala et son exemple d'un "écrivain élu". Les critiques affirment à maintes reprises que la théorie du design intelligent est basée sur la religion plutôt que sur la science, mais la réponse d'Ayala à mon livre est logique qui est basée sur un argument religieux, et distorse à plusieurs reprises la littérature scientifique dans une tentative flimsy de le soutenir. Il affirme que le génome humain présente des séquences sans sens et un montage négligent qui n'est pas digne d'un véritable designer intelligent. *Note : Cette série publiera une traduction du livre "Signature of Controversy", qui aborde quelques-unes des questions du livre "Sign in the Cell" et répond aux objections publiées depuis la publication du livre original. — Source: publié sur la page "centre du cerveau" de facebook https://www.facebook.com/braheen.org/posts/pfbid0Jbr7aj5cSHTSNZEdP3A6MqQL5mPEt88h7jLzo4gV4soTBqCybcEb8heNM6o52wvHl